Ngôi nhà tranh Mexico được nhà tự nhiên học người Anh George Robert Waterhouse mô tả lần đầu tiên vào năm 1848 như là một phần của công việc phân loại mẫu vật trong bộ sưu tập của bảo tàng Hiệp hội Động vật học London. Ba phân loài được công nhận: Sylvilagus cunicularius cunicularius, S. c. insolitus, và S. c. pacificus.